恭喜题主发现了道德心理学中的一个重要概念：moral dumbfounding effect （道德失声现象）。
如题主所说，对乱伦行为本身（而不是潜在负面后果）的反感是难以用理性解释的。Jonathan Haidt 提出，与其他一些道德直觉相同，对乱伦直觉上的反感先于合理化解释 *。因此，我们可以略微修改题主的问题：与其问我们因为什么理由而反感乱轮，不如问我们反感乱伦的直觉是如何在进化和社会化中形成的。
避免（如果不是惩罚）乱伦并非人类社会独有的现象。许多非人灵长类动物都会避免近亲交配#。因此，必须考虑进化因素。一个合理的解释是避免与近亲交配的个体避免了近亲交配带来的高遗传疾病率，因此更为成功。
当然，这并不能推出我们对乱伦的反对完全是先天的。无疑，社会化过程也会使我们接受并强化主流意见。至于主流意见的形成一方面当然与多数人的直觉有关，另一方面可能也有（例如）增加社会资源等考量。
* 关于这个问题（道德直觉先于理性解释）Haidt 写了一本书，很值得一读：
The Righteous Mind: Why Good People Are Divided by Politics and Religion (0884411977850): Jonathan Haidt: Books《正义之心:为什么人们总是坚持"我对你错"》 乔纳森·海特 (Jonathan Haidt), 舒明月, 胡晓旭【摘要 书评 试读】图书
# 参考：
Incest Avoidance
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