中间经历 RNA 的步骤个人认为更可能是历史原因造成的（
RNA 世界學說
）。
我写一点我临时想到的，如果还想到了其他的再来继续补充。
总的来看，经历的步骤数目越少，效率自然会越高，但是可供调节的选择就变少了，某一个反应可能成为控制许多个生物反应过程的关键，这就增加了调控的难度（例如，对新生肽链的翻译后修饰的重要性提高）。
当然，如果全部用 DNA ，效率方面的优化如果真的会起到好得多的效果的话，那么还是有可能进化出全部由 DNA 来转录翻译的生物来的，可是仍然有很多问题，我所想到的一些主要可能存在的问题包括：
（A）最极端的情况，所有 RNA 进行的工作全靠 DNA （催化功能假如都由蛋白质）来完成：
- DNA 的复制和被转录的过程中还常常用到 RNA 作为引物，引物与 DNA 序列的结合虽然同样涉及到互补配对，但是可以包容一定的错误（因为最后反正要切掉），因此复制和转录的准确率都比较高，如果没有 RNA 引物，而是 DNA 引物，那么就需要增加一种找到该从什么地方切断的酶，搜索功能往往是低效率的，而 DNA 的切断功能又增加了基因组产生插入缺失序列（Indel）的风险，这会在以后的复制过程中带来连锁反应式的越来越多的突变（Single-nucleotide mutation rate increases close to insertions/deletions in eukaryotes : Abstract : Nature）；如果没有 DNA 引物，那么开头序列又很可能出错。在这样的情况下，RNA 总是必不可少的。
（B）假设核糖体进入细胞核，在 DNA 上直接翻译，可能出现的问题包括：
- 核糖体的扩散系数与 mRNA 相比，因为粘滞阻力大大增加，扩散的效率也会降低。已经合成好的蛋白质从核内运输到核外（或者核糖体从核外运到核内）在核膜孔处都可能出现堵塞的情况。
- 在 DNA 序列上也很可能出现核糖体的拥堵。其他回答者已经提到，DNA 解螺旋是很麻烦的，因此最好是类似于 mRNA 被翻译的时候那样，同时有多个核糖体来翻译，在核内 DNA 上，这种拥堵相比起 mRNA 上的拥堵（Modeling dynamics of Translation）是更严重的。
（C）假设使用先翻译成 DNA，然后再进行翻译，可能出现的问题包括：
- 因为 DNA 实在是太稳定了，所以假设存在 mDNA，那么很可能它在运输过程中会折叠出复杂而且比 RNA 更稳定的三级结构，以至于在合成蛋白质的时候，还需要先解螺旋等等过程，这些都是需要酶的参加的。
- =。=我先写到这好了……
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