现在的观点差不多认为有鳞目（Squamata）=蜥蜴，蛇是蜥蜴的一支。
传统观点按形态把有鳞目分为蛇亚目和蜥蜴亚目，就好像一拍脑门把食肉目哺乳动物分为裂脚亚目和鳍脚亚目一样，都是想当然的做法。现代基因测序分类法认为，蛇只是诸多有鳞目分支中的一脉，实际上蛇与变色龙的关系比壁虎与变色龙的关系还近；既然壁虎和变色龙都算“蜥蜴”，那么毫无疑问蛇也算是蜥蜴；只不过蛇这一脉因为“无腿化”比较早而且发展的极为成功，具有强大的掠食能力，所以在食物链中占据的营养级普遍高于大多数蜥蜴，并且在人类文化中具有独特地位，将其和其他蜥蜴分支区分了开来而已。
现今地球上除了蛇这一支以外，还有种类繁多的“无腿化”蜥蜴隶属于有鳞目其他分支，例如：
以上“无腿蜥蜴”与蛇相比，最大的差距是它们缺乏蛇的掠食能力；蛇类的独门绝技——裂开下颌骨以吞食较大脊椎动物的能力，以及绞杀或毒牙等，“无腿蜥蜴”通常不具备，和其他大多数小型蜥蜴一样，这些东西是以食虫为主。
不过这里值得一提的是，有一些无腿蜥蜴正在向蛇的方向演化，其中的佼佼者是澳大利亚荒漠中的澳蛇蜥属（Lialis），该属与蛇蜥科（Anguidae）无关，而是属于鳞脚蜥科（Pygopodidae），是壁虎形类（Gekkonomorpha）的一支，可以视为无腿化的壁虎。
像蛇一样，澳蛇蜥已经趋同演化出了可开裂的下颌骨以及富有弹性的食道，能够囫囵吞下较大的脊椎动物；因此成年澳蛇蜥的主要猎物不是虫子，而是其他蜥蜴！虽然，它们暂时还没学会真蛇的缠绕绞杀能力，在捕猎时澳蛇蜥会一口咬住其他小型蜥蜴的颈部和胸腔，压迫呼吸道，坚持到对方因为窒息死亡后将其吞食；如果猎物挣扎力度有限，也可能会被活吞。
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